Bio-informatica

Bioinformatica is het gebruiken van computers om biologische problemen op te lossen.
Bioinformatica past kennis uit de informatica toe op biologische gegevens, met name op de gegevens die voortkomen uit genetisch onderzoek. Laboratoriumonderzoek op dit terrein levert zulke gigantische hoeveelheden gegevens op, dat ze alleen met behulp van informatica te verwerken zijn. Voor het ontrafelen, opslaan en het op een overzichtelijke manier toegankelijk en inzichtelijk maken van deze (bio)informatie worden computers gebruikt. Daarom heet dit werkterrein bioinformatica.

De bioinformatica heeft zich ontwikkeld tot een breed multidisciplinair onderzoeksgebied op het grensvlak van de levenswetenschappen en de informatietechnologie. Zo levert bioinformatica bijdragen op het gebied van landbouw, veeteelt, medische wetenschap, biologisch onderzoek aan o.a. virussen, biotechnologie, genetic engeneering, evolutieleer en forensisch onderzoek.
[http://nlt.bioinformatica.nl]

Les 1
- Installeren van Wamp en Aptana-studio
- variabelen

Les 2
- De if-instructie
- De while-instructie
- De for-instructie

Les 3
- Afwerken opdracht 7 blz. 49
- Functies
- De opdracht switch
- Zelf functies maken

Les 4
- Arrays
- Bestandsbeheer: lezen uit een tekstbestand

Les 5
- Bestandsbeheer: schrijven naar een tekstbestand
- Formulieren
- BioPortal website
- Het versturen van een FASTA-bestand
Het DNAmolecuul bestaat uit twee zeer lange ketens van nucleotiden. Beide ketens zijn complementair.
Biologische sequenties van DNA, RNA en eiwitten worden uniform en eenduidig in enorme databases opgeslagen
en beschikbaar gesteld in het FASTA formaat.
(http://biowiki.org/twiki/pub/Teaching/ArraysAndHashesLab/hemoglobin.fasta)

Les 6
- De POST en de GET-methode

Les 7
- Project deel 2 en 3

Les 8
- Project deel 4
- phpMyAdmin
- SQL

Les 9
- Gegevens uit een databasetabel tonen op een webpagina
- Formuliergegevens stoppen in een databasetabel

Les 10
- Gegevens bewerken in een databasetabel
- Gegevens verwijderen uit een databasetabel

Les 11
- Project deel 5, 6, 7
- Webpagina's beveiligen (sessies)

Les 12
- Captcha
- Project deel 8 en 9

Les 13
- Examen